2003年，成功申报“课程与教学论”专业硕士点，以将近满分的成绩获得通过。
2003年7月1日-10日，受福建省教育厅委托，中心在永春师范学校、集美大学举办“福建省第十期小学语文、数学学科骨干教师培训”，146人参加培训。
2003年7月15日，福建师范大学“课程与教学论”首届研究生课程进修班（福州班）正式开学，来自教育部、北京师大、华东师大、华南师大和我校课程改革专家讲授专业课程，全省17所一级达标中学的80多位骨干教师参加了学习。
2003年7月19日下午，教育部基础教育司朱慕菊副司长、福建省教育厅刘平副厅长到中心视察指导工作。
2003年7月17-21日，受福建省教育厅委托，中心在福州举办“福建省教育管理者（教育局局长和教师进修院校校长）新课程通识培训”，约300人参加培训。
2003年8月11-22日，受福建省教育厅委托，中心在福州艺术师范学校举办“福建省首届中小学中青年学科带头人培养对象集中理论研修班”，包括253名培养对象在内的共300多名骨干教师参加培训。
2003年10月8-19日，受教育部委托，中心在武夷山举办“第二期新课程中学艺术骨干培训者国家级研修班”，约120人参加培训。
2003年11月15日，中心与晋江市教育局联合举办的“课程与教学论”硕士研究生课程进修班（晋江班）正式开班，晋江市教育局机关、进修学校、中学共120人参加学习。
2003年11月，中心余文森教授的系列论文《“教学与发展”问题的教学论思考与实践性探索》获得福建省第五届社会科学优秀成果三等奖。
2003年11月，余文森教授的《走进新课程》（第二、四章）获得福建省第五届社会科学优秀成果一等奖。
2003年12月5-15日，受福建省教育厅委托，中心在武夷山举办“福建省特级教师高级研修班”，200多人参加培训。