2009年1月11-14日，由省教育厅委托中心承办的“福建省第三期高校招生自主命题教师培训会议”（文综、理综）在武夷山举行，参加培训的有文综和理综（物理、化学、生物、历史、地理、政治）六个学科的教师共1003人。1月15-19日，“福建省第三期高校招生自主命题教师培训会议”（语、数、英）在福州市梅峰宾馆举行，语、数、英三个学科的260名教师参加培训。培训活动采用了通识培训、学科培训交叉进行的方式。
2009年1月16日，省教育厅在福州梅峰宾馆召开“送培下乡”讲师团优秀成员表彰会。中心主任余文森教授，秘书陈国平、魏为燚以及15位获得表彰的讲师团成员参加表彰会。
2009年1月20-21日，余文森教授主持讨论《基础教育课程》杂志组稿工作，会议决定，2009年教学栏目围绕“先学后教”的教学思想来展开讨论，并确定了第三期教学教研栏目的主题为“闽派的先学后教”。
2009年2月5日，根据福建省教育厅、福建省财政厅印发《关于公布福建省高校服务海西建设重点项目的通知》（闽教高〔2009〕8号），中心主任余文森教授负责的“福建省高质量基础教育标准体系和保障体系建设研究”被确定为福建省高校服务海西建设重点项目。
2009年2月18日，厦门市海沧区委教育工作委员会副书记、海沧区教育局局长吴伟平，海沧区教师进修校校长孙明云以及教育局教育科科长陈元章等人来中心商讨合作事宜，中心余文森、陈国平、魏为燚、林高明参加座谈。双边经过充分交流与讨论，初步达成合作意向，中心将以“指导——自主学习”课题为切入口，指导海沧区进行教学改革，促进教学质量的提高。
《中国教育学刊》2008年第11期发表中心余文森教授的学术文章《论有效教学三条“铁律”》，该文被《新华文摘》2009年第5期全文转载。
2009年2月28日至3月1日，由高考研究中心承办的福建省普通高考自行命题教师培训工作研讨会在我校召开，语文、数学、英语、文综、理综各学科研究工作专家组及经我厅审核的命题教师人选（每个地区2名）参加，会议就对2009年福建省高中教学质检情况、中学教学与学生情况做了分析，就各学科高考命题研究成果进行了交流。
2009年3月12日，晋江市南侨中学与中心达成合作开展课题研究的协议。南侨中学校长刘清裕和教科室主任胡启山老师代表该校出席了签约仪式。根据协议，中心将与该校继续进行为期三年合作，指导该校进行高中新课程教学改革和“指导——自主学习”课题实验研究。
2009年3月13-14日，中心主任余文森教授和刘家访教授、张荣伟副教授以及学术秘书陈国平一行4人前往厦门市海沧区开展调研活动。
2009年3月15日至19日，应中心主任余文森教授的邀请，台北市立教育大学教育学院院长杨龙立教授来我校讲学。讲学主要内容为“台湾建构主义课程改革”、“台湾校本课程理论与实务”、“再概念课程观之评价”等。
2009年3月19日，中心英语、化学学科专家组一行赴晋江南侨中学指导教学改革。
2009年3月25日，闽侯县上街中心小学举办全国教育科学“十一五”规划教育部重点课题《新课程背景下“指导——自主学习”教改实验的深化研究》课题研讨活动，中心主任余文森教授、课题专家组成员、特级教师韩起柱，课题秘书陈国平、魏为燚、蒋益群以及来自加拿大的小学校长玛格丽特（Margrete）女士参加了本次活动。
2009年3月27日上午，全国教育科学“十一五”规划教育部重点课题《新课程背景下“指导——自主学习”教改实验的深化研究》福州片区小学语文研讨活动成功在鼓山苑小学开展。
2009年4月13-17日，由高考研究中心承办的福建省普通高考自行命题教师培训工作研讨会在我校召开，语文、数学、英语、文综、理综各学科研究工作专家组及经我厅审核的命题教师人选（每个地区2名）参加，会议内容为考试评价理论研修，我省中学教学与学生情况分析，各学科高考命题研究成果交流。
2009年4月17-18日，福建师大校党委统战部联络牵头，依托中心，组织了教学名师和骨干教师，前往宁德福安开展2009年海西春雨行动“送培下乡”农村教师培训活动。对福安农村300多位农村小学语文教师进行了小学语文教学基本技能和作文教学的培训。
2009年4月2日，中心课题实验学校福建师大二附小举办全国教育科学“十一五”规划教育部重点课题《新课程背景下“指导——自主学习”教改实验的深化研究》福州片区小学数学专题研讨活动。
2009年4月3日，中心课题实验学校莆田市逸夫实验学校举办全国教育科学“十一五”规划教育部重点课题《新课程背景下“指导——自主学习”教改实验的深化研究》莆田片区教学研讨活动”，共200多人参加。
2009年4月3日，经教育部基础教育课程教材发展中心基础教育课程杂志社办公会议研究决定，聘任中心魏为燚老师担任基础教育课程杂志特约编辑记者，负责杂志教学专题的策划、约稿、采写、编辑工作（课程杂志函[2009]006号）。
2009年4月9日上午，全国教育科学“十一五”规划教育部重点课题《新课程背景下“指导——自主学习”教改实验的深化研究》研讨活动成功在福州市晋安区第三中心小学开展。
2009年4月13日，中心生物、物理学科专家组赴南侨中学指导教学改革。
2009年4月17日至18日，校党委统战部联络牵头，依托中心，组织了5位福州市小学语文教学名师、骨干教师，赴宁德福安开展2009年海西春雨行动“送培下乡”农村教师培训，活动为期两天，采用了随堂教学观摩、讲座等形式对福安农村300多位农村小学语文教师进行了小学语文教学基本技能和作文教学的培训。
2009年4月21-22日，余文森教授前往莆田八中、莆田一中、莆田四中进行高考调研。
2009年4月24日，课程中心实验基地仓山实验小学举行课题研讨暨开放日活动，王永老师、韩起柱老师、刘一承教授、陈国平老师到会指导。
2009年4月28日，中心课题实验学校安徽省太和县桑营中学召开“新课程背景下师生关系”座谈会。
2009年4月30日，永泰县教育局在城南小学举办全国教育科学“十一五”规划教育部重点课题“新课程背景下‘指导——自主学习’教改实验深化研究”阶段性汇报活动。福州市区实验学校教师、永泰县教师进修学校相关人员和全县小学教师代表180多人参加了活动。
2009年5月14-16日，由中心主任余文森教授主持的全国教育科学“十一五”规划教育部重点课题《新课程背景下“指导——自主学习”教改实验的深化研究》2009年全国研讨会在厦门英才学校举行。来自全国各地70多所课题实验学校的老师，以及专家学者共200多人参加了本次研讨会。
2009年5月5日，《教师月刊》执行主编林茶居、编辑朱永通来到中心，就“有效教学”的理念及实施专访余文森教授。
2009年6月8日，中心负责的高考命题工作圆满完成，福建省高等学校招生考试结束，社会各界对命题质量给予高度评价。
2009年6月11-12日，中心主任余文森、学术秘书魏为燚作为教育部基础教育课程教材发展中心调研组成员，赴辽宁省丹东市凤城六中开展课程改革调研。
2009年6月15日，中心与网龙公司横向课题《基于网络游戏理念的新型学习方式研究》立项，总课题经费20万。
2009年6月19日-21日，由高考研究中心承办的福建省2009年普通高考自行命题工作研讨会在我校举行，语文、数学、英语、文综、理综各学科研究工作专家组及经省教育厅审核的命题教师人选参加会议，会议对2009年福建省高考情况做了分析，就各学科高考命题研究成果进行了交流。
2009年7月5-8日，受省教育厅委托，中心陈国平老师率“送培下乡”讲师团赴龙岩市连城县和长汀县开展农村教师培训活动。
2009年7月13日，我校印发《关于启用福建师范大学高考研究中心印章的通知》（师大学校办〔2009〕72号），启用“高考研究中心”公章。高考研究中心挂靠基础教育课程研究中心，合署办公。
2009年7月13-15日，受省教育厅委托，由中心陈国平老师带领的“送培下乡”讲师团到宁德市屏南县开展农村教师培训活动，220多名农村教师参加培训。
2009年7月25日至8月1日，由中心和厦门市海沧区教育局联合主办的“‘指导——自主学习’课题实验教师培训暨‘有效教学’专题研讨会”在武夷山市举行，共400多人参加会议。
2009年8月17-20日，厦门海沧教育局有委托中心举办的中小学管理者培训“优质教育”专题研修在武夷山华彩酒店举行，这是继中心完满承办厦门海沧区第二期骨干教师首次集中培训后又承担海沧区教育局委托的一项培训工作。海沧区中小学管理者94人参加培训。
2009年8月25-28日，中心主任余文森和副主任翁乾明赴晋江南侨中学开展新学期教师培训活动。
2009年9月4日，教育部基础教育二司申继亮副司长到中心调研。中心主任余文森教授向申司长汇报了中心的机构设置、运行模式以及近期的工作情况。申司长对中心多年来所取得的工作成绩给予了高度评价，对福建师范大学在财力、物力等方面大力支持课程中心的做法表示赞赏，他还表示要让其他兄弟院校的课程研究中心来我校学习先进经验。调研工作结束后，申司长和中心工作人员合影留念。
2009年9月，中心主任余文森教授组织申报的《教师教育课程体系构建、教材建设与教学改革》获福建省教学成果一等奖。
2009年10月17日，教育部、财政部联合印发《关于批准2009年度国家精品课程建设项目的通知》（教高函〔2009〕21号），中心主任余文森教授领衔主讲的《课堂教学》（网络教育）课程入选为国家级精品课程。
2009年11月，中心主任余文森教授的论文《论个体知识的课程论意义》获得福建省第八届社会科学优秀成果一等奖。
2009年12月21-22日，全国基础教育教学研究工作研讨会在北京召开，教育部副部长陈小娅出席会议并讲话。中心主任余文森教授参加会议并作专题发言。
2009年12月23日，中心与厦门市湖里区教育局联合在厦门市蔡塘学校举行“厦门市湖里区第十届素质教育暨‘指导—自主学习’教改实验课题研讨会”，参加研讨会的有来自省内外各课题实验学校的校长、教师以及厦门市湖里区教师代表350多人。
2009年12月24日，大田县作为中心“福建高校服务海西建设重点项目试点县”和“全国教育科学‘十一’规划教育部重点课题实验县”揭牌仪式在大田县城关第二小学举行，中心主任余文森教授、刘家访教授、张荣伟副教授、陈国平老师等参加揭牌仪式，三明市教育局副局长黄茂锋、大田县委教育工委副书记、县教育局长林镛以及大田县中小学校长近百人参加活动。